Некоторые отличия игрового процесса Psychonauts от других платформеров:

• Слияние геймплея с сюжетом. 1 Геймплей каждого этапа в Psychonauts существенно отличается от остальных и связан с сюжетом. 1 Например, игра связывает прошлое главного героя с платформингом, вводя хождение по канатам, трапеции и катание на шаре. 1
• Разнообразие уровней. 35 Каждый уровень выполнен в уникальном стиле и связан с ментальным состоянием разума изучаемого персонажа. 5
• Боевая система. 2 В её основе — комбинирование разнообразных пси-способностей, которые можно экипировать до трёх за раз. 2 В зависимости от используемых умений игра трансформируется в шутер, beat ’em up или экшен-RPG. 2
• Нестандартные правила в подсознаниях персонажей. 4 В ходе битв с большинством боссов приходилось не столько демонстрировать реакцию, сколько искать слабое место у противника. 4
• Постоянная смена обстановки. 4 Игра не даёт времени на отдых за счёт резкой смены обстановки, постоянно пополняющегося арсенала способностей и необходимости ими пользоваться. 4