Сюжет игры Watch Dogs заключается в стремлении хакера Эйдена Пирса отомстить за убийство своей племянницы. 3

Действие разворачивается в альтернативной версии реальности города Чикаго (штат Иллинойс), который является одним из многих городов, использующих операционную систему ctOS. 1 Система контролирует практически каждую часть города, а также содержит информацию обо всех его жителях и мероприятиях, которые могут быть использованы для различных целей. 1

Во вселенной игры авария в энергосистеме в США и Канаде была вызвана хакерами для побуждения развития ctOS. 1 Опасаясь за свою семью, Эйден увозит их в безопасное место под видом неожиданной поездки за город. 3 По дороге на них нападает наёмный убийца Морис Вега, в результате чего происходит автокатастрофа, в которой погибает шестилетняя племянница Эйдена Лена. 3

Год спустя Эйден выслеживает Вегу на бейсбольном стадионе, но безуспешно пытается установить личность своего подрядчика. 3 Оставив Вегу в руках своего партнёра, нанятого ремонтника Джорди Чина, Эйден навещает свою сестру Николь и племянника Джексона на день рождения последнего, но узнаёт, что кто-то их преследует. 3 С помощью Клары Лилль, члена хакерского синдиката DedSec, Эйден выслеживает преследователя, которым, как выяснилось, является Дэмиен, который хотел привлечь внимание Эйдена, чтобы тот помог ему найти другого хакера из Merlaut job. 3 Эйден отказывается, но, поговорив со свидетелем со стадиона, он узнаёт, что Дэмиен похитил Николь, чтобы заставить его подчиниться. 3

Обустраивая новое убежище в Бункере — необнаруживаемой бывшей базе Блюмов с доступом к CTO — Эйден выслеживает хакера с помощью Клары: главаря банды и ветерана армии Делфорда «Ирака» Уэйда. 3