Сюжет игры Doom рассказывает о том, как бизнесмены из Объединённой Аэрокосмической Корпорации (UAC) получили доступ в адские земли и решили черпать оттуда энергию. 3 Всё происходит на Марсе. 3

Учёная Оливия Пирс заключает договор с демонами, чтобы открыть портал между Марсом и Адом и позволить демонам завоевать человечество. 1 В результате демоны наводняют UAC и убивают почти весь персонал. 1

Чтобы отразить их, учёный Сэмюэл Хейден пробуждает персонажа игрока, Истребительницу, которая восстанавливает свою броню и поначалу игнорирует мольбы Хейдена. 1 Затем она соглашается помочь ему и начинает руководствоваться искусственным интеллектом ВЕГОЙ. 1

По сюжету Истребительница преследует Пирса в башне, разрушает инфраструктуру, критически важную для переработки энергии, и в итоге на вершине башни Пирс открывает взрывоопасный проход в Ад, разрушая башню и отправляя Истребительницу обратно в Ад. 1

Далее героиня узнаёт о Колодце, откуда приводится в действие портал, и о волшебном клинке Тигле. 1 Чтобы добраться до Колодца, она совершает ещё одну экскурсию в Ад с Серебряным аккумулятором внутри Кибердемона. 1

В финале Истребительница использует Тигель, чтобы уничтожить источник энергии портала, и противостоит Пирсу, которого демоны предали и превратили в Вдохновителя Пауков. 1

После убийства Вдохновителя-Паука Хейден телепортирует Истребительницу обратно на Марс, где она узнаёт, что победила и остановила вторжение. 1