Некоторые различия между Wrye Bash и Mod Organizer при установке модификаций:

Wrye Bash позволяет устанавливать и организовывать моды, управлять порядком их загрузки. 14 Главная особенность программы — создание специального esp-файла, «башед патча» (Bashed Patch). 1 Он объединяет уровневые списки из разных модов и даже полностью объединяет некоторые из них. 1

Mod Organizer не ставит моды в директорию игры, а держит их в своих директориях и при запуске создаёт виртуальное окружение. 3 В случае возникновения проблем в игре это позволяет отключить проблемный мод без необходимости переустановки всех остальных модов, а то и игры. 3

Кроме того, Wrye Bash может работать только с 32-битными играми, такими как оригинальный Skyrim (Skyrim LE) и более старые игры, например Fallout 3, Fallout NV, Oblivion, Morrowind. 1 Mod Organizer подходит для Skyrim SE, Fallout 4 и более новых игр. 1