Некоторые особенности игрового процесса Five Nights at Freddy's: Sister Location по сравнению с предыдущими играми серии:

• Динамичная игровая среда. 1 В отличие от предыдущих частей, где игрок сидел за столом и мониторил камеры и дверные проёмы, в Sister Location нужно перемещаться по комнатам и выполнять задания. 3
• Разные задачи на каждом уровне. 3 В отличие от предыдущих игр серии, в которых на игрока вели охоту все аниматроники заведения сразу, здесь на каждой ночи на игрока ведёт охоту определённый набор аниматроников. 2
• Отсутствие часов. 2 В игре нет часов, поэтому над одним заданием можно «просидеть» сколько угодно времени. 2
• Использование инструментов. 1 Для навигации по комнатам и усмирения аниматроников доступны различные инструменты, например, приподнятая панель управления для освещения комнаты или маячок для ориентирования в зале «Фантайм» Фредди. 1
• Указания от искусственного интеллекта. 3 В Sister Location нет Телефонного парня, который звонил игроку в начале каждого уровня, вместо него указания даёт искусственный интеллект (HandUnit) и один из аниматроников. 3