Некоторые особенности геймплея и игровой механики Serious Sam 2 по сравнению с предыдущими частями серии:

• Уделение большего внимания сюжету. 1 В предыдущих играх серии сюжет существовал только для того, чтобы переносить игрока с места на место, а основной задачей было убить как можно больше врагов. 1 Serious Sam 2 уделяет сюжету более заметное внимание, но по-прежнему основное внимание уделено уничтожению большого количества врагов. 1
• Система жизней. 1 В Serious Sam 2 игрок начинает с определённого количества жизней, которые представляют собой количество раз, когда разрешено потерять всё здоровье. 1
• Транспортные средства. 1 В игре представлены управляемые игроком транспортные средства, такие как ховеры и тарелки, оснащённые турелями. 1
• Боссы. 25 За одну игру предстоит побороться сразу с семью боссами, битва с которыми переносится в отдельный уровень. 2
• Новые бонусы. 2 Бонусы могут не только увеличивать урон и скорость, но и повышать счёт, поднимать игрока в воздух и даже делать его невидимым. 2
• Огневая поддержка. 2 Местные расы помогают бороться с врагом. 2
• Поддержка игрового процесса с разделением экрана. 1 Serious Sam 2 поддерживает такой процесс на ПК, но не поддерживает на Xbox. 1