Нельзя однозначно сказать, почему прозрачные фоны встречаются преимущественно в инди-играх. Однако есть некоторые особенности использования прозрачных пикселей в играх:
- Прозрачные пиксели часто применяют для пользовательского интерфейса (UI). habr.com
- При работе с прозрачными пикселями важно учитывать, что с каждым из них связано значение цвета. habr.com Если этого не делать, могут возникнуть искажения, которые не всегда заметны, но иногда бросаются в глаза. habr.com
- Многие программы по умолчанию заменяют данные RGB прозрачных пикселей сплошным цветом (белым или чёрным), чтобы улучшить сжатие. habr.com
- Текстуры в играх могут быть запрограммированы таким образом, что с одной стороны у них есть текстура, а с другой — её нет. otvet.mail.ru
Таким образом, использование прозрачных пикселей в играх может быть связано с разными факторами, которые влияют на выбор такого графического решения.