По мнению некоторых пользователей, Nintendo не реализовала функцию обратной совместимости с играми GBA для Nintendo 3DS из-за того, что игры GBA считались эксклюзивной особенностью консоли Wii U, и к моменту выхода 3DS создание эмулятора GBA для 3DS посчитали нецелесообразным. 1

Также есть предположение, что проблема могла быть связана с тем, что Nintendo предпочитала устанавливать эмулятор не на всю консоль, а связывать его с каждой отдельной игрой. 1

Кроме того, есть информация, что в Nintendo 3DS отсутствует слот для картриджей GBA, хотя технически консоль содержит части, позволяющие запускать игры GBA, но без специального считывателя картриджей. 2