Игра Subnautica получила множество наград и премий, в том числе:

• В 2018 году: 12

• Golden Joystick Awards. 2 Номинации на лучший визуальный и звуковой дизайн, а также победа в категориях «Компьютерная игра года» и «Ультимативная игра года». 2

• Gamers' Choice Awards. 2 Победа в категории «Любимая инди-игра фанатов». 1

• В 2019 году: 2

• D.I.C.E. Awards. 2 Номинация на «Выдающееся достижение в игровом дизайне». 2

• National Academy of Video Game Trade Reviewers Awards. 2 Номинация на «Игру года» и «Звуковые эффекты». 2

• 15-я Премия Британской академии игр. 2 Номинация на «Первоначальную собственность». 2

Subnautica получила преимущественно положительные отзывы критиков, в том числе за «гнетуще прекрасное» изображение подводного мира и мастерски сделанный симулятор выживания с неявным экологическим посылом. 2