Некоторые особенности игры Pro Evolution Soccer 2016 по сравнению с предыдущими версиями:

• Расширенная система столкновений. 1 В расчёт берётся множество факторов, которые определяют и создают уникальные единоборства на поле. 1
• Сила борьбы в воздухе. 1 С новой физической системой улучшилась борьба за мяч в воздухе. 1
• Управление один на один. 1 Обновлённая система финтов позволяет выйти из сложной ситуации, оставив защитника позади. 1
• Идеальная защита. 1 Выполнение подката в нужное время в нужном месте быстро оставляет нападающую сторону без мяча. 1
• Интеллектуальная игра. 1 Доступны комбинации с использованием 2–3 игроков, улучшена концепция управления стратегией игры. 1
• ID вратаря. 1 Добавлены новые вратарские параметры: фиксация мяча, чистый отбор, ловкость падения и блокирование/отбивание. 1
• Управление празднованием гола. 1 Впервые после забитого мяча игроком можно управлять, нажимая указанные кнопки. 1
• Прокачка игроков. 4 После каждого матча футболисты получают очки в соответствии с успешностью своих действий на поле. 4 Также каждого спортсмена можно тренировать персонально. 4