Несколько особенностей игры Red Alert 3, которые делают её популярной:

• Совместное прохождение. 12 Каждая миссия спроектирована с расчётом на то, что игрок играет не один, а вдвоём с приятелем. 1 Для этого в игре есть система навигации и внутреннего общения. 1
• Значительное внимание сражениям на воде. 2 Военная база игрока практически полностью может быть сооружена на воде, за исключением лишь казармы и военного завода. 2 Значительная часть юнитов способны передвигаться как по суше, так и по воде, а некоторые приобретают дополнительные возможности в тех или иных условиях. 2
• Отход от принципа «раш». 2 В отличие от предыдущих игр серии, нельзя победить, построив большое количество однотипных сильных юнитов, и здесь необходима комбинация разных войск. 2
• Своеобразные и необычные фракции. 3 На вооружении Союза — штурмовые медведи и робот «Серп», у Альянса — дельфин с ультразвуковым оружием, а у Японии — гигантские роботы, ниндзя с катанами и школьница, владеющая телекинезом. 3