Некоторые особенности игрового процесса Stellaris, которые делают её уникальной стратегией в космической тематике:

• Действие в реальном времени. 14 За основу отсчёта взят день, и каждое строение, улучшение, космический корабль или станция строятся определённое количество дней. 1
• Отсутствие привычного древа технологий. 1 В Stellaris можно вести исследования одновременно в трёх областях знаний (фундаментальные науки, инженерия, общественные науки). 1
• Система лидеров. 1 У каждого из них есть собственный бонус-усилитель. 1 С помощью лидеров можно изучать космос, вести армию в бой, проводить исследования в лабораториях, управлять колонией или сектором. 1
• Возможность создать свою цивилизацию. 2 Для этого есть продвинутый редактор рас, с помощью которого можно создать уникальных существ путём комбинации множества параметров. 4