Некоторые особенности геймплея, которые отличают Subnautica от других игр про выживание:

• Упор на исследование. 25 Игрок постоянно находит новые биомы, сканирует и изучает местную флору и фауну, узнавая об их свойствах. 3
• Отсутствие карты. 24 Чтобы прокладывать маршруты в процедурно созданном мире, нужно запоминать различные ориентиры. 2
• Возможность создать собственную базу. 2 Это позволяет дольше проводить время вдали от изначальной спасательной капсулы. 2
• Система крафта. 35 Она позволяет изготавливать не только очевидные вещи вроде ремонтных инструментов, ножей и ласт, но и целые подлодки, батискафы, экзокостюмы и даже полноценные базы. 3
• Отсутствие агрессии. 1 Бой не является основой геймплея, и игрок может создавать собственные убежища и маршруты, не прибегая к практике захвата территории. 1