Способности покемонов в игре Pixelmon влияют на игровой процесс следующим образом: они предоставляют пассивные эффекты, которые используются во время битвы и могут изменять ход сражения. 4

Некоторые примеры такого влияния:

• Sand Veil (Песочная завеса). 1 Увеличивает уклонение покемона на 25% во время песчаной бури. 1
• Inner Focus (Внутренний фокус). 1 Даёт покемону иммунитет к вздрагиванию. 1
• Insomnia (Бессонница). 15 Защищает покемона от сна. 1
• Intimidate (Запугивание). 1 Снижает атаку противника на одну ступень, когда покемон выходит на поле боя или начинает бой. 1
• Sand Stream (Поток песка). 15 Даёт возможность запустить песчаную бурю во время боя. 1

У каждого покемона может быть только одна способность, однако у некоторых есть возможность двух разных способностей. 1