Невидимый блок в Minecraft влияет на игровой процесс следующим образом: позволяет существующим блокам оставаться неизменными, а не переопределяться при использовании структурного блока для загрузки структуры. 1
Например, если игрок сохранит конструкцию высотой в 2 блока с воздухом наверху и пустотой в конструкции внизу и загрузит её в каменную зону высотой в 2 блока, верхний блок станет воздушным, а нижний останется каменным. 1
Также невидимые блоки могут быть предназначены для создания карт и других целей, когда их не нужно напрямую видеть игроку, не взаимодействующему с ними напрямую. 2
При этом в некоторых случаях невидимые блоки всё же можно увидеть, например, если в руках держать их иконку. 3