Чем отличаются системные и пользовательские модификации игровых файлов?

Возможно, имелись в виду различия между системными и пользовательскими (фанатскими) модификациями игровых файлов.

Системные модификации связаны с изменениями в исполняемых файлах, которые позволяют расширить функциональность игры или исправить ошибки. veg.by Такие модификации могут включать, например, поддержку конфигурационных файлов, перенос игры на другой компьютер или отключение проверки наличия CD. veg.by

Пользовательские (фанатские) модификации (моды) — это преобразования и изменения, которые вносятся в игру не разработчиком, а фанатской аудиторией. habr.com Они охватывают широкий спектр действий: от добавления новых уровней и персонажей до переосмысления основных игровых механик. blog.rt.ru

Таким образом, основное отличие заключается в том, что системные модификации связаны с изменениями в исполняемых файлах и направлены на решение конкретных задач, а пользовательские модификации включают в себя разнообразные преобразования, которые могут варьироваться от небольших правок до полного переписывания кода и имеют разные цели, например, улучшение визуала или добавление новых элементов. veg.by blog.rt.ru