Игровой процесс Minecraft Dungeons отличается от классической серии Zelda тем, что Minecraft Dungeons — это игра в жанре action/RPG с элементами данжен-кроулера, в то время как Zelda относится к другому жанру. 2

Некоторые особенности геймплея Minecraft Dungeons:

• Процедурно сгенерированные уровни. 4 Большая часть игры проходит на свежем воздухе, а не в подземельях. 4
• Отсутствие крафта и возможности ломать или ставить блоки. 5 Разработчики решили сосредоточиться на основном опыте прохождения подземелья. 5
• Использование найденного оружия, артефактов или доспехов. 5 Игрок может сделать их более мощными с помощью чар. 5
• Возможность изменять сложность игры. 5 Для опытных игроков команда добавила опцию изменять сложность игры. 5

При этом изначально Minecraft Dungeons задумывалась как игра, похожая на серию Zelda, и разрабатывалась как одиночная. 15 Но в процессе разработки от многих функций пришлось отказаться, и игра приобрела многопользовательский характер. 5