Некоторые отличия игры Super Mario Special от других игр серии Super Mario:

• Новые уровни. 1 В игре есть оригинальные новые уровни и механизм прокрутки экрана за экраном. 1
• Более сложная физика. 1 Прыжки и стремительная физика отличаются от оригинальной игры, время этапа немного быстрее, чем в Super Mario Bros.. 1
• Отсутствие Луиджи и многопользовательского режима. 1
• Графика и звук отличаются от оригинальной игры. 1 Из-за того, что технологии PC-8801 и X1 уступают технологиям NES/Famicom, графика и звук немного отличаются. 1
• Ограниченная цветовая палитра. 3 Игра ограничивается только четырьмя цветами: чёрным, красным, жёлтым и синим, причём в спрайтах использование синего цвета запрещено, чтобы обеспечить прозрачность. 3