Водный налог не уплачивается в случаях, когда вода используется для определённых целей, перечень которых прописан в статье 333.9 Налогового кодекса РФ. 45 Некоторые из них:

• тушение пожаров; 4
• выращивание рыбы; 4
• воспроизводство водных биологических ресурсов; 4
• полив сельхозугодий; 4
• рыбная ловля; 4
• добыча минеральной воды из подземных источников. 4

Также от налога освобождаются, например, забор воды для:

• ликвидации последствий аварий; 3
• нужд пожарной безопасности; 3
• обеспечения работы судового оборудования; 3
• санитарных, экологических и судоходных попусков; 15
• рыбоводства и воспроизводства водных биологических ресурсов; 15
• орошения земель сельхозназначения. 1

Кроме того, от налога освобождается использование акватории водных объектов для:

• плавания на судах, в том числе на маломерных плавательных средствах; 15
• разовых посадок или взлётов воздушных судов; 15
• размещения и стоянки плавательных средств, коммуникаций, зданий, сооружений, установок и оборудования для деятельности, связанной с охраной вод и водных биологических ресурсов, защитой окружающей среды от вредного воздействия; 15
• проведения дноуглубительных и других работ, связанных с эксплуатацией судоходных водных путей и гидротехнических сооружений; 15
• организованного отдыха организациями, предназначенными исключительно для содержания и обслуживания инвалидов, ветеранов и детей; 5
• рыболовства и охоты. 5

Полный список объектов, не подлежащих налогообложению, значительно шире. 2