Некоторые преимущества программно-целевого планирования:

• Концентрация ресурсов на реализацию взаимосвязанных мероприятий, возможность контроля за их расходованием, корректировки и стимулирования эффективного использования. 1
• Обеспечение прозрачности процесса расходования средств, что позволяет увязать результаты реализации программ с выделенными на их достижение бюджетными средствами. 3
• Чётко определённая ответственность за достижение целевых индикаторов и показателей программ, что вытекает из необходимости назначения исполнителя и соисполнителей, ответственных за реализацию программы. 3
• Повышение эффективности деятельности всех участников программы за счёт полномасштабного охвата всех сфер деятельности органов исполнительной власти и, как следствие, бюджетных ассигнований, находящихся в их распоряжении. 3
• Мобилизация дополнительных финансовых и материальных ресурсов для решения задач, требующих большой продолжительности инвестиционного цикла. 5