Некоторые основные функции руководителя Федеральной налоговой службы:

• Распределение обязанностей между заместителями. 13
• Представление Министру финансов Российской Федерации проекта положения о службе, предложений о предельной численности и фонде оплаты труда работников центрального аппарата и территориальных органов службы, а также других документов. 13
• Назначение на должность и освобождение от должности работников центрального аппарата службы, руководителей межрегиональных инспекций и инспекций межрайонного уровня. 1
• Решение вопросов, связанных с прохождением федеральной государственной службы в службе. 1
• Утверждение структуры и штатного расписания центрального аппарата службы, сметы расходов на её содержание. 1
• Утверждение численности и фонда оплаты труда работников территориальных органов службы, а также сметы расходов на их содержание. 1
• Издание приказов по вопросам, отнесённым к компетенции службы. 1