Ключевые отличия между работой обычных и специализированных налоговых инспекций заключаются в их задачах и полномочиях:
  - Обычные налоговые инспекции занимаются взаимодействием с основной массой налогоплательщиков: физическими и юридическими лицами.                                                                          journal.tinkoff.ru                       Они проводят выездные и камеральные налоговые проверки, могут вызвать на допрос, провести выемку документов и прийти в компанию с осмотром.                                                                          journal.tinkoff.ru                       Именно территориальные органы взыскивают налоги, если их кто-то вовремя не заплатил.                                                                          journal.tinkoff.ru                      
  - Специализированные налоговые инспекции контролируют определённый вид налогоплательщиков.                                                                          www.buhgalteria.ru                       Например, в Москве есть межрайонные инспекции по контролю за иностранными организациями и за строительной сферой.                                                                          www.buhgalteria.ru                       Во многих регионах есть межрайонные инспекции по контролю за крупными налогоплательщиками.                                                                          www.buhgalteria.ru                      
  
 Также специализированные инспекции занимаются повышением эффективности взыскания налоговой задолженности, предупреждением образования долга и побуждением к его погашению.                                                                          pravorf.ru                       При этом в их функции не входит администрирование объектов налогового контроля, это полномочие остаётся на стороне «обычных» налоговых инспекций.                                                                          pravorf.ru