Некоторые функции Федеральной таможенной службы в области управления финансами:

• Подготовка финансовых документов и финансирование текущих и инвестиционных расходов ФТС России, других таможенных органов, организаций, находящихся в ведении службы, и представительств службы в иностранных государствах. 12
• Ведение бюджетного учёта, в том числе учёт таможенных и иных платежей, составление и представление налоговой, бюджетной и иной финансовой отчётности. 12
• Консолидация, обобщение и анализ бюджетной и иной финансовой отчётности таможенных органов. 12
• Формирование и представление на утверждение руководству ФТС России прогнозных показателей доходов федерального бюджета от хозяйственной деятельности таможенных органов и организаций, находящихся в ведении службы, а также контроль поступления этих доходов. 1
• Мониторинг качества финансового менеджмента, осуществляемого распорядителями и получателями средств федерального бюджета, подведомственными ФТС России. 12
• Подготовка и анализ статистических и отчётных данных о финансировании таможенных органов и организаций, находящихся в ведении ФТС России. 14
• Назначение, перерасчёт и выплата пенсий, пособий, компенсаций и иных выплат гражданам, уволенным со службы в таможенных органах, и членам их семей. 14