Принципиальное отличие функционально-стоимостного анализа (ФСА) от классических методов учёта затрат заключается в следующем:

1. Традиционный учёт подразумевает, что объекты затрат потребляют ресурсы, а в ФСА принято считать, что объекты затрат потребляют функции. 2
2. Традиционный учёт в качестве базы распределения затрат использует количественные показатели, а в ФСА применяются источники издержек на различных уровнях. 2
3. Традиционный учёт ориентирован на структуру производства, а ФСА ориентирован на процессы (функции). 2

ФСА фокусируется на подсчёте затрат процессов, которые необходимы для производства продукта или предоставления услуги, а не на группировке затрат по статьям калькуляции. 4