Возможно, имелись в виду различия между сертификатом и электронной подписью.

Электронный счёт на интернет-площадке, например, может использоваться для разных целей, например, для обеспечения участия в торгах или оплаты услуг оператора. 1

Сертификат же связан с электронной подписью и позволяет подписывать документы в электронном виде. 34 Есть разные виды сертификатов, например:

• Простая электронная подпись. 3 Выступает как согласие на какое-то действие, но не даёт гарантии авторства. 3 Такую подпись можно использовать только в той информационной системе, средствами которой она создаётся. 4
• Усиленная электронная подпись. 4 Состоит из двух ключей (открытого и закрытого), а также сертификата, который связывает эту ключевую пару и личность подписывающего. 4 Такая подпись подтверждает авторство документа и отсутствие изменений после подписания. 4
• Квалифицированная электронная подпись. 3 Самый надёжный вид электронной подписи, отвечающий всем требованиям ФСБ. 3 Она приравнивается к собственноручной и имеет юридическую силу практически во всех сферах. 3

Таким образом, разница между сертификатом и электронным счётом заключается в их функциях и характеристиках.