Разница между ручным и регламентным списанием НДС в 1С заключается в уровне автоматизации процесса.

Ручное списание предполагает введение операции вручную. 1 Например, можно списать НДС, если нет оригинала счёт-фактуры или истек срок, дающий право предъявить налог к вычету. 1

Регламентное списание происходит с помощью специального документа, который заполняется автоматически. 1 Когда оформляют списание НДС таким документом, а не операцией, введённой вручную, автоматически выставляются корректные проводки. 1

Таким образом, регламентное списание обеспечивает более высокий уровень автоматизации, при этом есть возможность ручного вмешательства в процесс, например, для корректировки записей книги покупок и продаж. 2