В чем разница между налогоплательщиком ЮЛ и обычным Налогоплательщиком?

Возможно, имелась в виду программа «Налогоплательщик ЮЛ», которая автоматизирует процесс подготовки документов для представления в налоговые органы юридическими и физическими лицами. www.nalog.gov.ru

Понятие «налогоплательщик» в целом включает организации и физических лиц, на которых в соответствии с Налоговым кодексом РФ возложена обязанность уплачивать налоги, сборы и страховые взносы. www.consultant.ru

Таким образом, возможно, имелась в виду программа, которая помогает в работе с налоговыми документами, а не разница между какими-то конкретными категориями налогоплательщиков.