Разница между ИП и ООО с точки зрения бухгалтерского учёта в 1С заключается в выборе программы:

• Для ИП подходит, например, 1С:Упрощёнка. 23 Это специализированный вариант программы 1С:Бухгалтерия, предварительно настроенный под упрощённую систему налогообложения. 3 Позволяет работать одному бухгалтеру в программе, без возможности добавления новых пользователей. 3
• Для ООО рекомендуется 1С:Бухгалтерия Проф. 23 Это основная программа 1С для бухгалтерского учёта, которая поддерживает многопользовательский режим, возможность изменения конфигурации и ведения нескольких юридических лиц в одной информационной базе. 3

Кроме того, для всех ООО, кроме ушедших на налоговые каникулы, бухгалтерский учёт и бухотчётность обязательны, в то время как для ИП это необязательно. 5