Разница между документальным и фактическим налоговым контролем заключается в используемых методах. 35

Документальный контроль предполагает проверку документов, отчётов, планов, бухгалтерских книг, смет, деклараций и других документов, связанных с исчислением и уплатой налогов и сборов. 1 К документальным методам относят, например, истребование документации, её выемку, проверку на соответствие правовым нормам, обоснованности действий и правильности составления. 4

Фактический контроль включает в себя проверку фактически совершённых действий, например, имущественную инвентаризацию, встречную проверку по выполненным работам, контрольную закупку, экспертизу документов и вещей, анализ качества продукции. 4

Таким образом, документальный контроль фокусируется на документации, а фактический — на фактической деятельности налогоплательщика.