Разница между бумажной и электронной подачей уведомлений по НДФЛ заключается в способе подачи документа. astral.ru www.1cbit.ru
Бумажное уведомление можно принести в отделение ФНС лично, передать через своего представителя или отправить почтой. astral.ru Компании и ИП имеют право подать бумажное уведомление только в том случае, если они одновременно соответствуют двум условиям: не относятся к крупнейшим налогоплательщикам и среднесписочная численность их сотрудников за прошлый год и в текущем году не превысила 100 человек. astral.ru
Электронное уведомление можно подать через личный кабинет налогоплательщика или с помощью специальной программы для сдачи отчётности. astral.ru Для отправки в электронном виде организациям нужна УКЭП, а ИП она нужна только если они отправляют уведомление через операторов ЭДО. {6-host}
Таким образом, основное различие в том, что бумажное уведомление предоставляется в определённых случаях, а электронное — через специальные сервисы и с использованием электронной подписи.