Возможно, имелись в виду различия между автоматизированным и ручным формированием уведомлений по НДФЛ в программах, например «1С». 12

Автоматизированное формирование происходит с помощью встроенных помощников по расчёту и уплате налогов. 1 Программа сама заполняет уведомления на основании данных учётной системы. 1 Например, автоматически создаёт документ по отделениям налоговой службы, если у компании есть подразделения без отдельного баланса, или по КБК, если применяются разные процентные ставки налога. 2

Ручное формирование возможно, например, при создании промежуточного уведомления. 1 Такой документ нельзя сформировать автоматически, его создают вручную из списка уведомлений, без участия помощника по расчёту и уплате НДФЛ. 1

Таким образом, разница заключается в том, что автоматизированное формирование происходит без участия пользователя, а при ручном — человек самостоятельно заполняет документ.