Основное отличие партионного учёта от учёта по средней стоимости заключается в подходе к учёту товаров.

Партионный учёт предполагает, что каждое новое поступление товаров или продуктов учитывается отдельно. 3 При приёмке товара указывают наименование, сорт и саму партию, а на складе хранят её отдельно от ранее полученных товаров. 3 Партионный учёт применяют, когда важна информация о партиях товаров, например, при продаже на экспорт или ведении сложного учёта НДС. 2

Учёт по средней стоимости предполагает ежемесячный расчёт себестоимости товаров по среднему арифметическому. 1 При этом не имеет значения, из какой конкретно поставки «ушёл» тот или иной товар. 1 Такой метод подходит для компаний, торгующих изделиями, для которых штучный учёт не важен. 1 Например, канцтоварами, одеждой, обувью, игрушками, косметикой и другими товарами широкого потребления. 1

Таким образом, партионный учёт ориентирован на работу с партиями товаров, а учёт по средней стоимости — с товарами, для которых важен общий показатель себестоимости за определённый период.