Основное отличие налоговой экспертизы от финансово-кредитной заключается в предметах исследования.

Налоговая экспертиза направлена на изучение порядка исчисления и уплаты налогов, а также на установление соответствия действий налогоплательщика нормам налогового законодательства. 1 Её проводят при расследовании уклонения от уплаты налогов. 1

Финансово-кредитная экспертиза занимается исследованием степени кредитоспособности заёмщика и назначается при расследовании кредитных преступлений. 1 К компетенции этой экспертизы относятся, например, проблемы, связанные с операциями с ценными бумагами, инвестиционной деятельностью, взаимоотношениями в финансово-кредитной сфере. 4

Таким образом, налоговая экспертиза фокусируется на налоговых вопросах, а финансово-кредитная — на изучении кредитоспособности заёмщика и его финансового состояния.