Основное отличие бюджетных счетов от обычных расчётных счетов заключается в их назначении и условиях использования:

1. Бюджетные счета открываются для учёта движения средств организаций и структур, финансируемых из федерального бюджета. 7 Такие счета создаются и обслуживаются исключительно в Федеральном казначействе (по месту нахождения организации, получающей средства из госбюджета). 7
2. Расчётный счёт — основной инструмент для коммерческих компаний и индивидуальных предпринимателей. 1 Предназначен для повседневных финансовых операций: расчётов с контрагентами, выплаты зарплат и прочего. 1 Владелец расчётного счёта распоряжается суммами по своему усмотрению. 1

Таким образом, бюджетные счета позволяют контролировать движение бюджетных средств, а расчётные счета используются для повседневных операций с собственными финансовыми средствами компании, где владелец распоряжается суммами свободно. 14