Зейская ГЭС считается важным энергетическим объектом в Амурской области по нескольким причинам:

• Выработка электроэнергии. 12 В 2024 году станция выработала 5,594 млрд кВт·ч электроэнергии, что значительно превышает среднегодовой показатель в 4,9 млрд кВт·ч. 2 На долю Зейской ГЭС приходится около 20% всей вырабатываемой электроэнергии по объединённой энергосистеме Дальнего Востока. 4
• Защита региона от катастрофических наводнений. 1 Водохранилище станции имеет специальную противопаводковую ёмкость. 1 Благодаря строительству ГЭС уже с 1975 года были исключены серьёзные наводнения в нижнем течении Зеи и Амура. 4
• Способствование судоходству. 1 Зейская ГЭС при помощи специальных судоходных попусков способствует судоходству по Зее, в частности проводке караванов барж с оборудованием для строящегося Амурского газоперерабатывающего завода. 1