Несколько причин, по которым может возникать разница в расчёте НДФЛ при выплате авансов:

• Несоблюдение последовательности проведения документов начисления и выплаты заработной платы, участвующих при расчёте НДФЛ. 1
• Несоблюдение дат выплаты зарплаты и удержание НДФЛ. 1 Например, если в документе начисления аванса планируемая дата установлена позже реальной даты выплаты. 2
• Некорректный расчёт суммы НДФЛ при начислении аванса. 1 Например, если ведомость на аванс распроведена в момент начисления зарплаты или в ней нет суммы НДФЛ или она неверная. 4
• Влияние незакрытых сумм прошлого периода на расчёт НДФЛ в текущем периоде. 1

Чтобы избежать расхождений, рекомендуется правильно указывать планируемую дату выплаты и следить, чтобы она совпадала с фактической датой. 4