Несколько причин, по которым возникает излишне удержанный НДФЛ в 1С:

• Вычеты предоставлены задним числом. 3 Например, если сотрудник предоставил заявление на вычет не в январе, а марте, а зарплата за январь и февраль уже посчитана и НДФЛ рассчитан. 3
• Смена статуса с нерезидента на резидента. 3 В этом случае налог не подлежит возврату, а может быть зачтен только в расчёте следующих месяцев. 3
• Выполнение каких-либо перерасчётов. 3 Например, когда сотруднику была рассчитана зарплата за месяц, а впоследствии выяснилось, что был предоставлен отпуск без сохранения заработной платы. 3

Также на возникновение излишне удержанного НДФЛ в 1С может влиять сальдо по регистру «Расчёты налогоплательщиков с бюджетом по НДФЛ». 1 Например, если при проведении выплаты зарплаты есть движения с месяцами налогового периода прошлых лет, это может влиять на зачёт излишне удержанного НДФЛ. 1

Для устранения проблемы можно использовать обработку «Устранение излишне удержанного НДФЛ» в 1С. 5