Зейское водохранилище важно для энергетической системы России благодаря своей роли в работе Зейской ГЭС. 13

Водохранилище осуществляет все виды регулирования: многолетнее, сезонное, недельное и суточное. 1 Вода, перетекая с верхнего уровня плотины на нижний, вращает генератор, который кинетическую энергию вращения турбин генератора перерабатывает в электрическую. 1

Кроме того, Зейская ГЭС служит аварийным резервом — её гидроагрегаты в течение нескольких минут могут набрать полную мощность, не допуская отключения потребителей при авариях в энергосистеме. 4

Также водохранилище имеет большое противопаводковое значение — в нём создана специальная противопаводковая ёмкость, что позволяет сдерживать уровень воды в Зее и не допускать наводнений. 35