Несколько причин, по которым портовая инфраструктура на Европейском Севере России остаётся слаборазвитой:

• Слабое государственное финансирование. 2 После распада СССР объёмы государственной поддержки этого транспортного направления снизились. 1
• Физический и моральный износ портовых сооружений. 2 Основные портовые сооружения были построены до 70–80-х годов прошлого века, и с тех пор большинство из них не капитально ремонтировалось, строительство новых мощностей практически не производилось. 2
• Проблемы с инженерным обеспечением. 2 В северных портах и посёлках, расположенных на побережье, проблематично обеспечить население теплом, электроэнергией и пресной водой. 2
• Дефицит глубоководных морских терминалов и портовой инфраструктуры вдоль трассы Севморпути. 5 Для поддержания судоходных глубин на морских каналах в портах и на внутренних водных путях необходимы дноуглубительные работы, которые зачастую составляют большую часть общей стоимости портовых проектов. 5

Для развития портовой инфраструктуры в регионе в период 2025–2027 годов из федерального бюджета выделяются средства на федеральные проекты «Развитие опорной сети внутренних водных путей» и «Развитие опорной сети морских портов». 5