Округление суммы НДС в счёте-фактуре нельзя, потому что его заполнение регулируется специальным порядком, разработанным Правительством РФ (Постановление от 26.12.2011 №1137). 2

В этих правилах сказано, что стоимостные показатели документа, в том числе по графе «Сумма налога, предъявляемая покупателю», указываются в рублях и копейках. 2 Поэтому для НДС, который указывается в счёте-фактуре, предъявляемом продавцами покупателям, не применяется правило пункта 6 статьи 52 Налогового кодекса РФ об округлении суммы налога. 24

Если продавец всё-таки округлит сумму НДС в счёте-фактуре, то это может явиться формальным основанием для отказа покупателю в налоговом вычете. 1