Котону является экономическим центром Бенина, потому что это крупный портовый город, который служит основными воротами для импорта и экспорта в страну. 1
В городе развиты такие отрасли экономики, как производство пальмового масла, парфюмерных изделий, пива, напитков, цемента, текстиля, деревообрабатывающая промышленность, сборка велосипедов и мотоциклов. 2