Да, курсы повышения квалификации в бюджетных организациях оплачиваются. 25
В некоторых случаях это обязанность работодателя, например:
Расходы на повышение квалификации можно оплатить за счёт субсидии на выполнение государственного (муниципального) задания, средств от платной деятельности, целевой субсидии (если обучение не носит постоянного ежегодного характера) или средств ОМС (когда речь идёт о повышении квалификации медицинских работников). 2
Если занятия проходят в другом городе, сотруднику оплачивают расходы как при командировке по утверждённым нормам: проезд к месту обучения и обратно, наём жилья, суточные и иные расходы по соглашению с работодателем. 2