Роль Счётной палаты при рассмотрении проектов бюджетов государственных внебюджетных фондов заключается в следующем:

• Экспертиза проектов федеральных законов о бюджете и бюджетах государственных внебюджетных фондов на очередной финансовый год и плановый период. 15 Счётная палата проверяет и анализирует обоснованность их показателей, готовит и представляет палатам Федерального Собрания заключения на проекты законов. 15
• Экспертиза проектов федеральных законов о внесении изменений в федеральные законы о бюджете и бюджетах государственных внебюджетных фондов. 15
• Внешняя проверка годовой бюджетной отчётности главных администраторов средств федерального бюджета, годовых отчётов об исполнении федерального бюджета и бюджетов государственных внебюджетных фондов. 12
• Проверка бюджетов субъектов Российской Федерации и местных бюджетов — получателей межбюджетных трансфертов из федерального бюджета и бюджетов государственных внебюджетных фондов. 12
• Оперативный анализ исполнения и контроль за организацией исполнения федерального бюджета и бюджетов государственных внебюджетных фондов в текущем финансовом году. 12