Роль Федерального казначейства в администрировании бюджетных доходов заключается в следующем:

• Распределение между бюджетами бюджетной системы доходов от налогов, сборов и иных поступлений. 13 Это происходит с учётом перечислений излишне распределённых сумм и возвратов (зачётов, уточнений) излишне уплаченных или излишне взысканных сумм, а также сумм начисленных процентов по установленным законом нормативам. 1
• Перечисление доходов на единые счета соответствующих бюджетов в порядке, установленном Минфином России. 1
• Возврат (по распоряжению администратора доходов) излишне уплаченных или излишне взысканных доходов. 1

Кроме того, Федеральное казначейство контролирует соответствие поступивших доходов кодам бюджетной классификации России, определяет предназначение невыясненных поступлений, учитывает их и, в случае необходимости, возвращает. 12