Некоторые последствия реформы совнархозов для советской экономики:

• Дезинтеграция экономики. 12 Нарушились сложившиеся производственные, отраслевые и межотраслевые связи. 1
• Оторванность научно-исследовательских, конструкторских и проектных организаций от промышленных предприятий. 1 Это привело к снижению качества проектирования, строительства и реконструкции предприятий, затормозило внедрение новых технологий, машин и оборудования. 1
• Обострение проблемы местничества. 4 Областные руководители нередко нарушали государственные планы, перераспределяя ресурсы в пользу «своих» предприятий. 4 Это негативно сказывалось на развитии соседних регионов и вело к снижению темпов роста. 4

Среди положительных последствий реформы можно выделить увеличение национального дохода, производственных фондов, производства промышленной продукции, улучшение жилищных условий населения и введение зарплат и пенсий колхозникам. 3

К середине 1960-х годов тенденция централизации возобладала, и совнархозы были ликвидированы, а территориально распределённая система управления экономикой заменена на жёстко централизованную отраслевую систему управления посредством отраслевых министерств и межотраслевых государственных комитетов. 12