Селенга имеет значительное значение для гидроэнергетики и промышленности. 1

Для гидроэнергетики река обладает значительным гидроэнергетическим потенциалом. 1 Она обеспечивает до половины ежегодного притока воды в Байкал, в том числе около 70% всего терригенного притока. 1 В бассейне Селенги ведётся добыча бурого угля, в нижнем течении имеются источники минеральных вод. 1

Для промышленности в верховьях Селенги и в её среднем течении развита горно-металлургическая промышленность Монголии. 2 Отходы от обогащения руд цветных металлов являются серьёзными загрязнителями реки. 2

Кроме того, до конца XX века по Селенге осуществлялось промышленное и туристическое судоходство от Байкала до города Сухэ-Батора. 1