Рио-Негро имеет следующее значение в экономике Уругвая:

• Судоходство. 14 В нижней части река активно применяется в судоходстве. 1
• Производство энергии. 1 На русле Рио-Негро построено несколько ГЭС. 1
• Образование водохранилищ. 14 В средней части реки образованы водохранилища, в том числе Ринкон-дель-Бонете, которое считается наибольшим на территории Южной Америки. 1
• Развитие департамента Рио-Негро. 3 Во Фрай-Бентосе находится один из главных портов западного побережья Уругвая. 3 В департаменте в достаточной степени развита железнодорожная инфраструктура. 3 На территории департамента находится международный мост «Генерал Сан-Мартин», соединяющий Уругвай с Аргентиной. 3