В Южно-Якутском бассейне существуют следующие проблемы:
Недостаточное соответствие уровня производства мировому научно-техническому уровню. 1 Высокая энергоёмкость, отсталые технологии, нерациональное использование месторождений, потери и загрязнение окружающей среды. 1
Ухудшение среды обитания человека. 1 Изменение ландшафтов, развитие процессов эрозии, нарушение почвенного покрова, загрязнение воздушного бассейна, воды, обеднение биологического разнообразия. 1
Нарушение земель. 2 Строительство карьеров, отсыпка отвалов, возведение промышленных сооружений, прокладка дорог и других коммуникаций. 2 Нарушенные земли длительное время представляют собой бесплодные пустыни, отрицательное воздействие которых распространяется на прилегающие территории. 2
Изменение гидрогеологии района горных работ. 2 Осушение месторождений ведёт к нарушению режима подземных вод, водообеспечения озёр и рек, перераспределяются запасы пресной воды. 2
Проблемы развития угольной отрасли. 3 Ограничение рынков сбыта угля, несбалансированная ценовая политика, недоиспользование производственных мощностей, низкая производительность труда, высокая степень износа оборудования, слабая техническая оснащённость. 3