В Южно-Якутском каменноугольном бассейне существуют следующие проблемы:

• Недостаточное соответствие уровня производства мировому научно-техническому уровню. 1 Высокая энергоёмкость, отсталые технологии, нерациональное использование месторождений, потери и загрязнение окружающей среды. 1

• Ухудшение среды обитания человека. 1 Изменение ландшафтов, развитие процессов эрозии, нарушение почвенного покрова, загрязнение воздушного бассейна, воды, обеднение биологического разнообразия. 1

• Нарушение земной поверхности. 2 Строительство карьеров, отсыпка отвалов, возведение промышленных сооружений, прокладка дорог и других коммуникаций. 2 Нарушенные земли длительное время представляют собой бесплодные пустыни, отрицательное воздействие которых распространяется на прилегающие территории. 2

• Изменение гидрогеологии района горных работ. 2 Осушение месторождений ведёт к нарушению режима подземных вод, водообеспечения озёр и рек, перераспределяются запасы пресной воды. 2

• Логистические риски. 3 Планы по экспортным поставкам угля в направлении АТР, возможность перевозки лишь определённого объёма, что означает появление логистических рисков. 3

• Проблема с утилизацией большого количества промежуточного продукта. 3 При обогащении образуется большое количество промежуточного продукта с зольностью более 25–30% (25–40% от рядового угля). 3 Такое топливо может быть востребовано только на крайне ограниченном внутреннем рынке Дальнего Востока. 3