Основные причины возникновения разрывов по НДС:

1. Технические ошибки при заполнении налоговой декларации одной из сторон сделки. 3 Например, когда одна из сторон неправильно записала реквизиты счёта-фактуры в книге продаж. 2 Данные не совпадают, и налоговая просто «не видит» документы по сделке. 2
2. Неправомерное применение налоговых вычетов по неподтверждённым (несуществующим) операциям (схемные расхождения). 3 То есть речь идёт о том, что сам поставщик или его контрагенты по сделке (например, предыдущие собственники товара) умышленно не заплатили НДС в бюджет. 3

Также к другим причинам возникновения разрывов по НДС можно отнести, например:

• заявлен вычет, а контрагент не сдал декларацию или сдал «нулевую» отчётность; 2
• работник покупателя в личных интересах закупил товар в одной фирме, а документы принёс от другой; 2
• продавец ошибся и не указал продажу в книге продаж; 2
• покупатель неправильно отразил операцию в книге покупок; 2
• не совпали реквизиты счёта-фактуры по одной сделке; 2
• в ЕГРЮЛ или ЕГРИП нет сведений о контрагенте, с которым была сделка. 2